Les collections du musée s'organisent en deux départements:
* Les Sciences de la Terre et l'archéologie
Beaux-Arts
Les collections de géologie, paléontologie et archéologie présentent la région de Lodève depuis 540 millions d'années jusqu'à la période gallo-romaine. Le département Beaux-Arts réunit notamment un ensemble d'oeuvres du sculpteur Paul Dardé et une collection d'Art contemporain.