Le musée présente le résultat des fouilles sur 1 000 mètres carrés répartis en deux niveaux
- contact avec le monde étrusque, un centre de redistribution du commerce grec de Marseille
- l'agglomération gallo-romaine de la cité de Nîmes
Le musée s'ouvre aussi au "pays lagunaire" environnant, depuis la rive nord de l'étang de Mauguio jusqu'à l'île de Maguelone ainsi qu'à la moyenne vallée du Lez ; depuis le Néolihique avec le développement du Chasséen (au milieu du Ve-milieu du IVe millénaires), jusqu'à l'Antiquité tardive (VIe-VIIe siècles).